电泳检验测定：质粒电泳普通有三条带，作别为质粒的超螺旋、开环、线型三种构型

吸光值检验测定：认为合适而使用分光光度计检验测定260nm、280nm波长吸光值，若吸光值260nm/280nm的比率介于1.7－1.9之间，解释明白质粒品质较好，1.8为*，低于1.8解释明白有氨基酸污染，大于1.8解释明白有RNA污染。

实验材料：包括质粒pUC18载体的结肠杆菌菌液，克隆有稻子外源断片的BAC的结肠杆菌菌液电热恒温鼓风干燥箱。

实验原理：在pH 12.0 ~ 12.6碱性背景中，球菌的线性大分子量染色体DNA改变性别分开，而共价闭环的质粒DNA固然改变性别但仍处于拓扑搅扰状况。将pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下，大多染色体DNA、大分子量的RNA和氨基酸在去污剂SDS的效用下形成沉淀，而质粒DNA还是为可溶状况。经过离心，可去掉除掉大多细胞碎片、染色体DNA、RNA及氨基酸，质粒DNA尚在上清中，而后用酚、氯仿抽提进一步醇化质粒DNA。

实验步骤：

1.取包括pUC18质粒的结肠杆菌菌液于LA营养物质上真空干燥箱37℃过夜培育；

2.汲取1.5 ml菌液，12000 g离心2分钟，使聚在一起菌体，倒掉菌液；汲取1.5 ml菌液，再次使聚在一起菌体，尽力将菌液倒整洁；

3.参加300 ml溶液 I振动打匀，从新悬浮细胞，震动混电热鼓风干燥箱匀（注意：应*打匀沉淀或碎块）；

4.用无菌牙签儿挑取单菌落，接种于包括Amp抗生素的LB营养物质中，37℃摇床~250 r/min过夜培育；

5.参加300 ml溶液III颠倒混匀，安放于冰上10分钟，使杂质充分沉淀；

6.参加300 ml溶液II，轻柔颠倒混匀，安放至清脆，普通不超过5分钟；

7.12000 g离心10分钟；

8.汲取800 ml上清液（注意：不要汲取到漂浮的杂质）至另一Eppendorf管中，参加2/3大小的异丙醇，室温下安放5分钟干燥箱；

9.质粒、BAC的品质检验测定，于-20℃保留。

10.倒尽上清，加75酒精浸洗除盐（安放一会儿或离心3分钟后倒去上清）；

11.12000 g 常温离心15分钟；

12.室温安放或超净台上风干DNA；

13.加40 ml灭菌超纯水或TE溶解；